Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem50aQ9CXL1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms