Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nip7Q9CXK8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms