Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms