Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX92

Gje1, Gap junction epsilon-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gje1Q9CX92 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gje1Q9CX92 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gje1Q9CX92 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gje1Q9CX92 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gje1Q9CX92 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gje1Q9CX92 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gje1Q9CX92 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gje1Q9CX92 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gje1Q9CX92 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gje1Q9CX92 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gje1Q9CX92 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gje1Q9CX92 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gje1Q9CX92 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gje1Q9CX92 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gje1Q9CX92 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gje1Q9CX92 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms