Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf1Q9CWX2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf1Q9CWX2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms