Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pin4Q9CWW6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms