Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnbl1Q9CWL8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnbl1Q9CWL8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnbl1Q9CWL8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms