Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BccipQ9CWI3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms