Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms