Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms