Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms