Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ska2Q9CR46 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ska2Q9CR46 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ska2Q9CR46 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ska2Q9CR46 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ska2Q9CR46 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ska2Q9CR46 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ska2Q9CR46 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms