Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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