Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms