Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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