Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQ90 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQ90 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQ90 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms