Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb3bpQ9CQ82 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3bpQ9CQ82 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms