Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.28■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.28■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700129C05RikQ9CQ77 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms