Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pkp2Q9CQ73 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms