Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms