Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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