Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc198Q9CPZ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc198Q9CPZ1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc198Q9CPZ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc198Q9CPZ1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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