Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV3

Mrpl42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl42Q9CPV3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl42Q9CPV3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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