Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms