Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd3Q99PL7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms