Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rrbp1Q99PL5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rrbp1Q99PL5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rrbp1Q99PL5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms