Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep41Q99NF3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms