Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rims1Q99NE5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rims1Q99NE5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms