Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms