Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcgf6Q99NA9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms