Protein–RNA interactions for Protein: Q99MD6

Txnrd3, Thioredoxin reductase 3, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd3Q99MD6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd3Q99MD6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd3Q99MD6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms