Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tm2d1Q99MB3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tm2d1Q99MB3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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