Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms