Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms