Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms