Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms