Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmp1Q99KU0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms