Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf34Q99KR6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf34Q99KR6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf34Q99KR6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf34Q99KR6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf34Q99KR6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf34Q99KR6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf34Q99KR6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf34Q99KR6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms