Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms