Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms