Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufsp2Q99K23 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms