Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms