Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms