Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ripply3Q924S9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripply3Q924S9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms