Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prss28Q924N9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prss28Q924N9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prss28Q924N9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prss28Q924N9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prss28Q924N9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prss28Q924N9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms