Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Alpk3Q924C5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Alpk3Q924C5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms