Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms