Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms