Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atl3Q91YH5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms