Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms